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CAS 140712-83-0

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Cytidin, N-benzoyl-3'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2'-desoxy-, 5'-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidit]

Beschreibung:
Cytidin, N-benzoyl-3'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2'-desoxy-, 5'-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidit] ist ein synthetisches Nukleosidderivat, das hauptsächlich im Bereich der Molekularbiologie und Biochemie verwendet wird, insbesondere bei der Synthese von Oligonukleotiden. Diese Verbindung weist eine Cytidinbasis auf, die ein Nukleosid ist, das aus einer Pyrimidinbase (Cytosin) und einem Ribosezucker besteht, modifiziert mit einer Benzoylgruppe und einer Phosphoramiditgruppe. Das Vorhandensein der 3′-O-Benzoyl- und 5′-Cyanethylphosphoramiditgruppen erhöht die Stabilität und Reaktivität, wodurch es für die automatisierte DNA-Synthese geeignet ist. Die bis(4-Methoxyphenyl)phenylmethylsubstituente trägt zu seinen hydrophoben Eigenschaften bei, was potenziell die Löslichkeit und die Wechselwirkung mit anderen Biomolekülen beeinflussen kann. Diese Verbindung wird typischerweise unter kontrollierten Bedingungen gehandhabt, aufgrund ihrer Reaktivität, und wird in Forschungsanwendungen eingesetzt, die die Gensynthese, molekulare Klonierung und die Entwicklung therapeutischer Oligonukleotide betreffen. Bei der Arbeit mit dieser Substanz sollten angemessene Sicherheitsmaßnahmen beachtet werden, aufgrund ihrer chemischen Eigenschaften.
Formel:C46H52N5O8P
InChl:InChI=1S/C46H52N5O8P/c1-32(2)51(33(3)4)60(56-29-13-27-47)57-31-41-40(30-43(58-41)50-28-26-42(49-45(50)53)48-44(52)34-14-9-7-10-15-34)59-46(35-16-11-8-12-17-35,36-18-22-38(54-5)23-19-36)37-20-24-39(55-6)25-21-37/h7-12,14-26,28,32-33,40-41,43H,13,29-31H2,1-6H3,(H,48,49,52,53)/t40-,41+,43+,60?/m0/s1
InChI Key:InChIKey=OXUQZHDIUOKQGM-SALLYJDFSA-N
SMILES:C(O[C@@H]1[C@@H](COP(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N)O[C@H](C1)N2C(=O)N=C(NC(=O)C3=CC=CC=C3)C=C2)(C4=CC=C(OC)C=C4)(C5=CC=C(OC)C=C5)C6=CC=CC=C6
Synonyme:
  • N4-Benzoyl-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine-5'-cyanoethyl Phosphoramidite
  • Cytidine, N-benzoyl-3′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxy-, 5′-[2-cyanoethyl bis(1-methylethyl)phosphoramidite]
  • Cytidine, N-benzoyl-3′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxy-, 5′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite]
  • DMT-dC(Bz)-5'-CE Reverse Phosphoramidite
  • N4-Benzoyl-2'-deoxy-3'-O-DMT-cytidine 5'-CE phosphoramidite
  • (N4-BENZOYL)-5'-O-[(N,N-DIISOPROPYLAMINO)-(2-CYANOETHOXY)PHOSPHINYL]-3'-O-(4,4'-DIMETHOXYTRITYL)-2'-DEOXYCYTIDINE
  • N4-Bz-3’-O-DMTr-2’-deoxycytidine 5’-O-CE-phosphoramidite
  • DMT-dC(Bz)-CE Reverse Phosphoramidite
  • (N4-Benzoyl)-5'-O-[(N,N-diisopropylamino)(2-cyanoethoxy)phoshinyl}-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine
  • Cytidine,N-benzoyl-3'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2'-deoxy-, 5'-[2-cyanoethylbis(1-methylethyl)phosphoramidite] (9CI)
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