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CAS 74405-40-6

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5'-O-Dimethoxytrityl-3'-O-succinatothymidin

Beschreibung:
5'-O-Dimethoxytrityl-3'-O-succinatothymidin ist ein modifiziertes Nukleosidderivat der Thymidin, das durch die Anwesenheit einer Dimethoxytrityl (DMT) Schutzgruppe an der 5′-Position und einer Succinatgruppe an der 3′-Position gekennzeichnet ist. Diese Verbindung wird typischerweise im Bereich der Nukleinsäurechemie verwendet, insbesondere bei der Synthese von Oligonukleotiden, bei denen Schutzgruppen für selektive Reaktionen unerlässlich sind. Die DMT-Gruppe dient dazu, die Hydroxylgruppe an der 5′-Position während der Synthese zu schützen, was die kontrollierte Zugabe von Nukleotiden ermöglicht. Die Succinatgruppe an der 3′-Position kann eine weitere Konjugation oder Modifikation erleichtern und die Nützlichkeit der Verbindung in Biokonjugationsanwendungen erhöhen. Das Vorhandensein dieser funktionellen Gruppen trägt zur Stabilität und Reaktivität der Verbindung bei, was sie zu einem wertvollen Zwischenprodukt bei der Synthese komplexerer Nukleinsäurestrukturen macht. Darüber hinaus sind die Löslichkeit und Stabilität der Verbindung in verschiedenen Lösungsmitteln wichtige Eigenschaften, die ihre Anwendung in Laborumgebungen beeinflussen.
Formel:C35H36N2O10
InChl:InChI=1S/C35H36N2O10/c1-22-20-37(34(42)36-33(22)41)30-19-28(47-32(40)18-17-31(38)39)29(46-30)21-45-35(23-7-5-4-6-8-23,24-9-13-26(43-2)14-10-24)25-11-15-27(44-3)16-12-25/h4-16,20,28-30H,17-19,21H2,1-3H3,(H,38,39)(H,36,41,42)/t28-,29+,30+/m0/s1
InChI Key:InChIKey=ZGIVSINMMBIEBQ-FRXPANAUSA-N
SMILES:C(OC[C@@H]1[C@@H](OC(CCC(O)=O)=O)C[C@@H](O1)N2C(=O)NC(=O)C(C)=C2)(C3=CC=C(OC)C=C3)(C4=CC=C(OC)C=C4)C5=CC=CC=C5
Synonyme:
  • 1-{5-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3-O-(3-carboxypropanoyl)-2-deoxypentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  • 3′-O-(3-Carboxypropanoyl)-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine
  • 5'-O-(p,p'-Dimethoxytrityl)thymidine 3'-(hydrogen succinate)
  • 5′-O-(DMTr)thymidine 3′-O-succinate
  • 5′-O-Dimethoxytrityl-3′-O-succinatothymidine
  • Thymidine, 5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-, 3′-(hydrogen butanedioate)
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