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CAS 74405-40-6

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5'-O-Dimetoxitrityl-3'-O-succinatotimidina

Descripción:
5'-O-Dimetoxitrityl-3'-O-succinatotimidina es un derivado de nucleósido modificado de la timidina, caracterizado por la presencia de un grupo protector dimetoxitriptilo (DMT) en la posición 5′ y un moiety de succinato en la posición 3′. Este compuesto se utiliza típicamente en el campo de la química de ácidos nucleicos, particularmente en la síntesis de oligonucleótidos, donde los grupos protectores son esenciales para reacciones selectivas. El grupo DMT sirve para proteger el grupo hidroxilo en la posición 5′ durante la síntesis, permitiendo la adición controlada de nucleótidos. El grupo succinato en la posición 3′ puede facilitar una conjugación o modificación adicional, mejorando la utilidad del compuesto en aplicaciones de bioconjugación. La presencia de estos grupos funcionales contribuye a la estabilidad y reactividad del compuesto, convirtiéndolo en un intermediario valioso en la síntesis de estructuras de ácidos nucleicos más complejas. Además, la solubilidad y estabilidad del compuesto en varios disolventes son características importantes que influyen en su aplicación en entornos de laboratorio.
Fórmula:C35H36N2O10
InChI:InChI=1S/C35H36N2O10/c1-22-20-37(34(42)36-33(22)41)30-19-28(47-32(40)18-17-31(38)39)29(46-30)21-45-35(23-7-5-4-6-8-23,24-9-13-26(43-2)14-10-24)25-11-15-27(44-3)16-12-25/h4-16,20,28-30H,17-19,21H2,1-3H3,(H,38,39)(H,36,41,42)/t28-,29+,30+/m0/s1
Clave InChI:InChIKey=ZGIVSINMMBIEBQ-FRXPANAUSA-N
SMILES:C(OC[C@@H]1[C@@H](OC(CCC(O)=O)=O)C[C@@H](O1)N2C(=O)NC(=O)C(C)=C2)(C3=CC=C(OC)C=C3)(C4=CC=C(OC)C=C4)C5=CC=CC=C5
Sinónimos:
  • 1-{5-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3-O-(3-carboxypropanoyl)-2-deoxypentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  • 3′-O-(3-Carboxypropanoyl)-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine
  • 5'-O-(p,p'-Dimethoxytrityl)thymidine 3'-(hydrogen succinate)
  • 5′-O-(DMTr)thymidine 3′-O-succinate
  • 5′-O-Dimethoxytrityl-3′-O-succinatothymidine
  • Thymidine, 5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-, 3′-(hydrogen butanedioate)
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