CAS 1027512-41-9

Ester N-succinimidilico di 6-carbossitetrametilrodamina

Descrizione:

Ester N-succinimidilico di 6-carbossitetrametilrodamina, spesso abbreviato come TMR o TMR-OSu, è un colorante fluorescente comunemente utilizzato nella bioconjugazione e nelle applicazioni di etichettatura nella ricerca biochimica. Questo composto presenta un nucleo di rodamina, noto per le sue forti proprietà di fluorescenza, rendendolo adatto per applicazioni come la microscopia e la citometria a flusso. La presenza del gruppo carbossilico consente ulteriori coniugazioni con biomolecole, mentre la parte dell'estere N-succinimidile facilita la formazione di legami ammidici stabili con ammine primarie in proteine o altre biomolecole. Questo colorante mostra alta fotostabilità e luminosità, che sono critiche per le applicazioni di imaging. Inoltre, ha un coefficiente di estinzione relativamente alto e un rendimento quantico, contribuendo alla sua efficacia come marcatore fluorescente. Il composto è tipicamente solubile in solventi organici e ha lunghezze d'onda di eccitazione ed emissione specifiche, rendendolo utile per la multiplexazione in saggi basati sulla fluorescenza. In generale, Ester N-succinimidilico di 6-carbossitetrametilrodamina è uno strumento versatile nella biologia molecolare per visualizzare e tracciare biomolecole.

Formula: C₂₉H₂₅N₃O₇

InChI: InChI=1S/C29H25N3O7/c1-30(2)17-6-9-20-23(14-17)38-24-15-18(31(3)4)7-10-21(24)27(20)22-13-16(5-8-19(22)28(35)36)29(37)39-32-25(33)11-12-26(32)34/h5-10,13-15H,11-12H2,1-4H3

InChI key: InChIKey=PAOQTZWNYMMSEE-UHFFFAOYSA-N

SMILES: C([O-])(=O)C1=C(C=2C3=C([O+]=C4C2C=CC(N(C)C)=C4)C=C(N(C)C)C=C3)C=C(C(ON5C(=O)CCC5=O)=O)C=C1

Sinonimi:

• 6-TAMRA-SE
• Xanthylium, 9-[2-carboxy-5-[[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]carbonyl]phenyl]-3,6-bis(dimethylamino)-, inner salt
• 6-TAMRA-NHS ester
• 2-[3-(Dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]-4-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylbenzoate
• 6-Carboxytetramethylrhodamine N-succinimidyl ester