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CAS 74405-40-6

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5'-O-Dimetossitrityl-3'-O-succinatotimidina

Descrizione:
5'-O-Dimetossitrityl-3'-O-succinatotimidina è un derivato di nucleoside modificato della timidina, caratterizzato dalla presenza di un gruppo protettore dimetossitriptilo (DMT) nella posizione 5′ e di un moiety di succinato nella posizione 3′. Questo composto è tipicamente utilizzato nel campo della chimica degli acidi nucleici, in particolare nella sintesi di oligonucleotidi, dove i gruppi protettori sono essenziali per reazioni selettive. Il gruppo DMT serve a proteggere il gruppo idrossile nella posizione 5′ durante la sintesi, consentendo l'aggiunta controllata di nucleotidi. Il gruppo succinato nella posizione 3′ può facilitare ulteriori coniugazioni o modifiche, aumentando l'utilità del composto nelle applicazioni di bioconjugazione. La presenza di questi gruppi funzionali contribuisce alla stabilità e reattività del composto, rendendolo un intermedio prezioso nella sintesi di strutture di acidi nucleici più complesse. Inoltre, la solubilità e stabilità del composto in vari solventi sono caratteristiche importanti che influenzano la sua applicazione in contesti di laboratorio.
Formula:C35H36N2O10
InChI:InChI=1S/C35H36N2O10/c1-22-20-37(34(42)36-33(22)41)30-19-28(47-32(40)18-17-31(38)39)29(46-30)21-45-35(23-7-5-4-6-8-23,24-9-13-26(43-2)14-10-24)25-11-15-27(44-3)16-12-25/h4-16,20,28-30H,17-19,21H2,1-3H3,(H,38,39)(H,36,41,42)/t28-,29+,30+/m0/s1
InChI key:InChIKey=ZGIVSINMMBIEBQ-FRXPANAUSA-N
SMILES:C(OC[C@@H]1[C@@H](OC(CCC(O)=O)=O)C[C@@H](O1)N2C(=O)NC(=O)C(C)=C2)(C3=CC=C(OC)C=C3)(C4=CC=C(OC)C=C4)C5=CC=CC=C5
Sinonimi:
  • 1-{5-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3-O-(3-carboxypropanoyl)-2-deoxypentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  • 3′-O-(3-Carboxypropanoyl)-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine
  • 5'-O-(p,p'-Dimethoxytrityl)thymidine 3'-(hydrogen succinate)
  • 5′-O-(DMTr)thymidine 3′-O-succinate
  • 5′-O-Dimethoxytrityl-3′-O-succinatothymidine
  • Thymidine, 5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-, 3′-(hydrogen butanedioate)
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