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CAS 118362-03-1

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5'-O-(4,4-Dimetoxitrityl)-2'-O-[(tert-butil)dimetilsilil]uridina-3'-(2-cianoetil-N,N-diisopropil)fosforamidita

Descripción:
La sustancia química conocida como "5'-O-(4,4-Dimetoxitrityl)-2'-O-[(tert-butil)dimetilsilil]uridina-3'-(2-cianoetil-N,N-diisopropil)fosforamidita," con el número CAS 118362-03-1, es un fosforamidito de nucleósido modificado utilizado principalmente en la síntesis de oligonucleótidos. Este compuesto presenta una base de uridina, que es un nucleósido compuesto de un azúcar ribosa y una base de uracilo, modificada en las posiciones 5' y 2' para mejorar la estabilidad y reactividad durante la síntesis. La presencia del grupo 4,4-Dimetoxitriptil en la posición 5' actúa como un grupo protector, mientras que el grupo tert-butil dimetilsililo en la posición 2' proporciona protección adicional contra la hidrólisis. La porción cianoetilo-N,N-diisopropilo fosforamidito en la posición 3' es crucial para las reacciones de acoplamiento en la síntesis de oligonucleótidos. En general, este compuesto se caracteriza por su estabilidad, reactividad y utilidad en el campo de la biología molecular, particularmente en la síntesis de secuencias de ARN y ADN para aplicaciones de investigación y terapéuticas.
Fórmula:C45H61N4O9PSi
InChI:InChI=1S/C45H61N4O9PSi/c1-31(2)49(32(3)4)59(55-29-15-27-46)57-40-38(56-42(48-28-26-39(50)47-43(48)51)41(40)58-60(10,11)44(5,6)7)30-54-45(33-16-13-12-14-17-33,34-18-22-36(52-8)23-19-34)35-20-24-37(53-9)25-21-35/h12-14,16-26,28,31-32,38,40-42H,15,29-30H2,1-11H3,(H,47,50,51)/t38-,40-,41-,42-,59?/m1/s1
Clave InChI:SKNLXHRBXYGJOC-ZMHKPELYSA-N
SMILES:CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@@H]1[C@H](O[C@H]([C@@H]1O[Si](C)(C)C(C)(C)C)N2C=CC(=O)NC2=O)COC(C3=CC=CC=C3)(C4=CC=C(C=C4)OC)C5=CC=C(C=C5)OC
Sinónimos:
  • Dmt-2'O-Tbdms-Ru Amidite
  • 2'-TBDMS-rU Phosphoramidite
  • 5'-O-DMT-2'-TBDMS-rU-3'-CEDPA
  • rU Phosphoramidite
  • 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(t-butyl-dimethylsilyl)-uridine-3'-cyanoethyl Phosphoramidite
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