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CAS 121058-88-6

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N-Acétyl-5'-O-(4,4-diméthoxytrityl)-2'-O-[(tert-butyl)diméthylsilyl]cytidine-3'-(2-cyanoéthyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite

Description :
N-Acétyl-5'-O-(4,4-diméthoxytrityl)-2'-O-[(tert-butyl)diméthylsilyl]cytidine-3'-(2-cyanoéthyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite est un composé chimique complexe principalement utilisé dans le domaine de la chimie des acides nucléiques, en particulier pour la synthèse des oligonucléotides. Ce composé présente plusieurs groupes fonctionnels clés, y compris un moiety de phosphoramidite, qui est crucial pour les réactions de couplage dans la synthèse des oligonucléotides. La présence de groupes protecteurs, tels que les groupes diméthoxytrityle et tert-butyle diméthylsilyle, indique que ce composé est conçu pour protéger les sites réactifs pendant la synthèse, améliorant ainsi la stabilité et la solubilité. Le groupe acétyle contribue à la stabilité et à la solubilité globales de la molécule. Le groupe cyanoéthyle est impliqué dans l'activation de la phosphoramidite pour l'attaque nucléophile lors du processus d'assemblage des oligonucléotides. Dans l'ensemble, ce composé illustre le design sophistiqué des réactifs utilisés dans les techniques modernes de biologie moléculaire, facilitant la construction précise de séquences d'ADN et d'ARN pour des applications de recherche et thérapeutiques.
Formule :C47H64N5O9PSi
InChI :InChI=1S/C47H64N5O9PSi/c1-32(2)52(33(3)4)62(58-30-16-28-48)60-42-40(59-44(43(42)61-63(11,12)46(6,7)8)51-29-27-41(49-34(5)53)50-45(51)54)31-57-47(35-17-14-13-15-18-35,36-19-23-38(55-9)24-20-36)37-21-25-39(56-10)26-22-37/h13-15,17-27,29,32-33,40,42-44H,16,30-31H2,1-12H3,(H,49,50,53,54)/t40-,42-,43-,44-,62?/m0/s1
Code InChI :QKWKXYVKGFKODW-ZYRNLWDWSA-N
SMILES :CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@H]1[C@@H](O[C@@H]([C@H]1O[Si](C)(C)C(C)(C)C)N2C=CC(=NC2=O)NC(=O)C)COC(C3=CC=CC=C3)(C4=CC=C(C=C4)OC)C5=CC=C(C=C5)OC
Synonymes :
  • 2'-TBDMS-rC(N-Ac) Phosphoramidite
  • 5'-O-DMT-2'-TBDMS-rC(N-Ac)-3'-CEDPA
  • Ac-rC Phosphoramidite
  • N4-Acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(t-butyl-dimethylsilyl)-cytidine-3'-cyanoethyl Phosphoramidite
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