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CAS 121058-88-6

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N-Acetil-5'-O-(4,4-dimetossitril)-2'-O-[(tert-butil)dimetilsilil]citidina-3'-(2-cianoetil-N,N-diisopropil)fosforamidite

Descrizione:
N-Acetil-5'-O-(4,4-dimetossitril)-2'-O-[(tert-butil)dimetilsilil]citidina-3'-(2-cianoetil-N,N-diisopropil)fosforamidite è un composto chimico complesso utilizzato principalmente nel campo della chimica degli acidi nucleici, in particolare per la sintesi di oligonucleotidi. Questo composto presenta diversi gruppi funzionali chiave, tra cui un moiety di fosforamidite, che è cruciale per le reazioni di accoppiamento nella sintesi di oligonucleotidi. La presenza di gruppi protettivi, come i gruppi dimetossitriptil e tert-butile dimetilsilile, indica che questo composto è progettato per proteggere siti reattivi durante la sintesi, migliorando stabilità e solubilità. Il gruppo acetile contribuisce alla stabilità e solubilità complessiva della molecola. Il gruppo cianoetile è coinvolto nell'attivazione della fosforamidite per attacco nucleofilo durante il processo di assemblaggio degli oligonucleotidi. In generale, questo composto esemplifica il design sofisticato dei reagenti utilizzati nelle moderne tecniche di biologia molecolare, facilitando la costruzione precisa di sequenze di DNA e RNA per applicazioni di ricerca e terapeutiche.
Formula:C47H64N5O9PSi
InChI:InChI=1S/C47H64N5O9PSi/c1-32(2)52(33(3)4)62(58-30-16-28-48)60-42-40(59-44(43(42)61-63(11,12)46(6,7)8)51-29-27-41(49-34(5)53)50-45(51)54)31-57-47(35-17-14-13-15-18-35,36-19-23-38(55-9)24-20-36)37-21-25-39(56-10)26-22-37/h13-15,17-27,29,32-33,40,42-44H,16,30-31H2,1-12H3,(H,49,50,53,54)/t40-,42-,43-,44-,62?/m0/s1
InChI key:QKWKXYVKGFKODW-ZYRNLWDWSA-N
SMILES:CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@H]1[C@@H](O[C@@H]([C@H]1O[Si](C)(C)C(C)(C)C)N2C=CC(=NC2=O)NC(=O)C)COC(C3=CC=CC=C3)(C4=CC=C(C=C4)OC)C5=CC=C(C=C5)OC
Sinonimi:
  • 2'-TBDMS-rC(N-Ac) Phosphoramidite
  • 5'-O-DMT-2'-TBDMS-rC(N-Ac)-3'-CEDPA
  • Ac-rC Phosphoramidite
  • N4-Acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(t-butyl-dimethylsilyl)-cytidine-3'-cyanoethyl Phosphoramidite
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