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CAS 330628-04-1

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2'-Desossi-N2-DMF-5'-O-DMT-guanosina 3'-CE fosforamidite

Descrizione:
2'-Desossi-N2-DMF-5'-O-DMT-guanosina 3'-CE fosforamidite è un analogo di nucleoside modificato utilizzato principalmente nella sintesi di oligonucleotidi. Questo composto presenta uno zucchero desossiribosio, caratteristico dei nucleotidi del DNA, ed è modificato nella posizione N2 della base di guanina con un gruppo di dimetilformammide (DMF), migliorando la sua solubilità e stabilità durante la sintesi. Il gruppo 5'-O-DMT (dimetossitriptil) funge da gruppo protettivo, consentendo reazioni selettive durante l'assemblaggio degli oligonucleotidi. La funzionalità 3'-CE (cianoetile) della fosforamidite è cruciale per la formazione di legami fosfodiestere, facilitando l'incorporazione di questo nucleotide in catene di DNA in crescita. Questo composto è tipicamente utilizzato in sintetizzatori automatici per la produzione di sequenze di DNA personalizzate, rendendolo prezioso nella ricerca, nella diagnostica e nelle applicazioni terapeutiche. La sua stabilità, solubilità e profilo di reattività sono essenziali per una sintesi efficiente di oligonucleotidi, contribuendo ai progressi nella biologia molecolare e nell'ingegneria genetica.
Formula:C43H53N8O7P
InChI:InChI=1S/C43H53N8O7P/c1-29(2)51(30(3)4)59(56-24-12-23-44)58-36-25-38(50-28-45-39-40(50)47-42(48-41(39)52)46-27-49(5)6)57-37(36)26-55-43(31-13-10-9-11-14-31,32-15-19-34(53-7)20-16-32)33-17-21-35(54-8)22-18-33/h9-11,13-22,27-30,36-38H,12,24-26H2,1-8H3,(H,47,48,52)/b46-27+/t36-,37+,38+,59?/m0/s1
InChI key:YRQAXTCBMPFGAN-UNHDIWNRSA-N
SMILES:CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1COC(C2=CC=CC=C2)(C3=CC=C(C=C3)OC)C4=CC=C(C=C4)OC)N5C=NC6=C5N=C(NC6=O)/N=C/N(C)C
Sinonimi:
  • DMF-dG Phosphoramidite
  • N2-Dimethylfromamidine-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyguanosine-3'-cyanoethyl Phosphoramidite
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